Medici-kapellene blander renessanse- og barokkstiler. Inndelt i to seksjoner - det nye sakristiet og fyrstenes kapell - hedrer de Medici-dynastiets arv gjennom kunst og arkitektur. Begge områdene gjenspeiler familiens rikdom og innflytelse, og fungerer som storslåtte mausoleer og kunstneriske landemerker.

Det nye sakristiet kombinerer elementer fra klassikeren og renessansen. Den kubiske utformingen har en kuppel, hvite vegger og grå pietra serena-stein. Gravene viser Michelangelos skulpturer -Dag, Natt, Daggry, Skumring- som symboliserer tidens gang. Selv om det var uferdig, fullførte Giorgio Vasari senere verket, med bevaring av dets dramatiske kontrast og følelsesmessige dybde.

Dette barokkapellet ble bygget av Matteo Nigetti, og blender med fargerik marmor og halvedelstener. Den åttekantede utformingen, kronet av en 59 meter høy kuppel, rommer seks storslåtte sarkofager for Medici-herskerne. Verkstedet Opificio delle Pietre Dure laget intrikate innfatninger og forvandlet rommet til en glitrende hyllest til Mediciernes makt og håndverkskunst.

Sammen hyller kapellene Medici-familiens proteksjonisme og Firenzes kunstneriske geni. Michelangelos nyskapende design og kapellets overdådige materialer fremhever overgangen mellom renessanse og barokk. De er fortsatt varige symboler på rikdom, hengivenhet og tidens mesterskap innen arkitektur og dekorativ kunst.

Det nye sakristiet, tegnet av Michelangelo, er et mausoleum som fungerer som Siste hvilested for medlemmer av Medici-familien. Her finnes skulpturer av Michelangelo, blant annet Daggry, Skumring, Dag, og Natt , som pryder gravene til Giuliano og Lorenzo de' Medici. Kapellet er arkitektonisk på linje med Brunelleschis gamle sakristi, men forblir uferdig på grunn av Michelangelos avgang fra Firenze, slik at Lorenzos og Giulianos levninger står uten storslåtte gravmæler.

Dette storslåtte åttekantede mausoleet er kjent for sitt overdådige interiør, utsmykket med marmor, granitt, jaspis og halvedelstener. Her finnes sarkofagene til seks Medici-storhertuger og deres koner. Kuppelen, som er designet av Buontalenti, er rundt 60 meter høy og har fresker som illustrerer scener fra Bibelen. Kapellet er et vitnesbyrd om Medici-familiens rikdom og innflytelse, og et eksempel på barokkarkitektur, en stil som var mindre vanlig i Firenze på den tiden.

Krypten ligger under Medici-kapellene, og rommer gravene til flere medlemmer av Medici-familien, blant annet noen av storhertugene av Toscana og deres koner. Krypten er en del av komplekset som inkluderer det nye sakristiet og fyrstenes kapell, og fungerer som gravplass for mindre kjente medlemmer av Medici-familien. Krypten er kjent for sin høytidelige, enkle, men likevel virkningsfulle design, som står i kontrast til storheten i de øvre kapellene.

Lorraine-krypten ligger bak kryptalteret, under koret i Basilikaen San Lorenzo i Firenze. Her ligger levningene etter Lorraine-familien, som etterfulgte Medici-slekten som herskere i Toscana. Krypten ble nylig gjenåpnet for publikum etter restaureringsarbeid, og gir et glimt inn i Lorraine-dynastiets historie og deres forbindelse til Medici-familien.

Relikviekammeret rommer utsøkte hellige gjenstander, blant annet skrin med hellige relikvier laget av kostbart sølv og gull. Relikviene er knyttet til helgener og martyrer, noe som gjenspeiler Medici-familiens hengivenhet til kirken. Blant de bemerkelsesverdige relikvieskrinene kan nevnes det som er viet Johannes Døperen og St. Kammeret har også malerier av anerkjente kunstnere som Botticelli og Ghirlandaio.