Medicee-kapellerne blander renæssance- og barokstil. Opdelt i to sektioner - det nye sakristi og fyrsternes kapel - ærer de Medicee-dynastiets arv gennem kunst og arkitektur. Begge steder afspejler familiens rigdom og indflydelse og fungerer som storslåede mausoleer og kunstneriske vartegn.

Det nye sakristi kombinerer klassiske og renæssanceelementer. Dens kubiske layout har en kuppel, hvide vægge og grå pietra serena-sten. Gravene viser Michelangelos skulpturer -Dag, Nat, Daggry, Skumring- der symboliserer tidens gang. Selvom det var ufærdigt, færdiggjorde Giorgio Vasari senere værket og bevarede dets dramatiske kontrast og følelsesmæssige dybde.

Dette barokkapel blev bygget af Matteo Nigetti og blænder med farverige kugler og halvædelstene. Dens ottekantede design, kronet af en 59 meter høj kuppel, huser seks store sarkofager for Medici-herskere. Værkstedet Opificio delle Pietre Dure lavede indviklede indlægninger og forvandlede rummet til en glitrende hyldest til Medici-magten og -håndværket.

Sammen fejrer kapellerne Medici-familiens mæcenat og Firenzes kunstneriske geni. Michelangelos innovative design og kapellets overdådige materialer fremhæver overgangen mellem renæssance og barok. De er stadig varige symboler på rigdom, hengivenhed og tidens beherskelse af arkitektur og dekorativ kunst.

Det nye sakristi, der er designet af Michelangelo, er et mausoleum, der fungerer som det sidste hvilested for medlemmer af Medici-familien. Den indeholder skulpturer af Michelangelo, bl.a. Dawn, Dusk, Day og Night , som pryder Giuliano og Lorenzo de' Medicis grave. Kapellet er arkitektonisk på linje med Brunelleschis gamle sakristi, men forbliver ufærdigt på grund af Michelangelos afgang fra Firenze, hvilket efterlader Lorenzo og Giulianos jordiske rester uden store grave.

Dette store ottekantede mausoleum er kendt for sit overdådige interiør, der er udsmykket med marmor, granit, jaspis og halvædelsten. Den rummer sarkofager af seks Medici-storhertuger og deres hustruer. Kuplen, der er designet af Buontalenti, er ca. 60 meter høj og har fresker, der illustrerer scener fra Bibelen. Kapellet er et vidnesbyrd om Medici-familiens rigdom og indflydelse og et eksempel på barok arkitektur, en stil, der var mindre almindelig i Firenze på det tidspunkt.

Medicee-kapellet ligger under Medicee-kapellet og rummer gravene for flere medlemmer af Medici-familien, herunder nogle af storhertugerne af Toscana og deres hustruer. Krypten er en del af det kompleks, der omfatter det nye sakristi og fyrsternes kapel, og som fungerer som gravplads for mindre kendte medlemmer af Medici-familien. Krypten er kendt for sit højtidelige, enkle, men effektfulde design, der står i kontrast til de øverste kapellers storhed.

Lorraine-krypten ligger bag kryptalteret under koret i basilikaen San Lorenzo i Firenze. Den huser resterne af Lorraine-familien, som efterfulgte Medicierne som herskere over Toscana. Krypten blev for nylig genåbnet for offentligheden efter restaureringsarbejde og giver et indblik i Lorraine-dynastiets historie og deres forbindelse til Medici-familien.

Relikviekammeret huser udsøgte hellige genstande, bl.a. skrin med hellige relikvier lavet af kostbart sølv og guld. Relikvierne er forbundet med helgener og martyrer, hvilket afspejler Medici-familiens hengivenhed over for kirken. Bemærkelsesværdige relikvieskrin omfatter det, der er dedikeret til Johannes Døberen og Skt. Cosimo, udsmykket med farvede emaljer. Kammeret indeholder også malerier af kendte kunstnere som Botticelli og Ghirlandaio.